Onder ‘microbiologie' verstaan we het opsporen  van verwekkers van infectieziekten  zoals bacteriën, virussen, gisten, schimmels, parasieten in stalen van een patiënt. We doen dat zowel met klassieke als met nieuwe snelle technieken. Zo wordt een belangrijke bijdrage geleverd om de juiste diagnose te stellen. Daarnaast heeft het laboratorium microbiologie een belangrijke adviserende rol over de behandeling van infecftieziekten. We onderzoeken onder meer aan welke antibiotica de bacteriën gevoelig zijn zodat de behandelende arts op basis van deze informatie  het juiste antibioticum kan toedienen bij bijvoorbeeld een longontsteking of urineweginfectie.